Bemerkungen für Schulen: Natriumdithionit reizt Haut, Augen und Schleimhäute. Bei der Aufnahme durch Verschlucken treten Verdauungs- und Herz-Kreislauf-Störungen auf. Manche Personen reagieren besonders empfindlich auf das durch Zersetzung mit Wasser freigesetzte Natriumdisulfit, dann können asthmatische Beschwerden auftreten. Natriumdithionit muss absolut trocken und unter Luftabschluss aufbewahrt werden. Wird das Pulver feucht und kommt noch Luft hinzu, kann es sich selbst erhitzen und zu brennen beginnen.

Das lockere weiße Pulver hat einen typischen, leicht reizenden Geruch. Das wasserfreie Natriumdithionit kann sich stark erhitzen, vor allem wenn es an der Luft feucht wird. Das Dihydrat ist unter bestimmten Umständen schon im trockenen Zustand selbstentzündlich. In schwach alkalischer Lösung ist es recht stabil, in wässriger, schwach saurer Lösung zersetzt es sich rasch zu Natriumthiosulfat und Natriumdisulfit.

Bei Vorhandensein von Luft ist auch eine Zersetzung zu Natriumhydrogensulfat möglich. Aus diesen Gründen muss Natriumdithionit unbedingt trocken in einem gut geschlossenen Behälter mit dunklem Glas aufbewahrt werden, besser noch ist die Aufbewahrung im Originalgebinde. Lösungen für die Küpenfärbung mit Indigo dürfen nur frisch zubereitet werden. Beim Erhitzen auf über 52 °C beginnt sich Natriumdithionit unter Abgabe von Schwefeldioxid zu zersetzen. 

In eine Zinkstaub-Aufschlämmung wird bei 40 °C Schwefeldioxid eingeleitet. Hierbei entsteht Zinkdithionit:

Durch eine Reaktion des Produkts mit Natronlauge erhält man Zinkhydroxid und Natriumdithionit in wässriger Lösung:

Aufgrund ihrer Eigenschaft, dass die Dithionite relativ leicht zerfallen, eignen sie sich als Bleich- oder Reduktionsmittel in der Druck-, Textil- und Papierindustrie. Beim Färben mit dem Küpenfarbstoff Indigo wird bei der Verküpung der blaue Indigo mit Hilfe von Natriumdithionit zu Indigoweiß umgewandelt, das mit der zugegebenen Natronlauge ein wasserlösliches Salz bildet. Nach dem Tauchen der Textilien in die Küpe, färben sie sich durch das Indigoweiß gelb. Erst an der Luft oxidiert dieses dann wieder zum blauen Indigo, so dass die typische, jeansblaue Farbe entsteht.